В будущем вследствие глобального потепления бо́льшая часть суши погрузится под воду. В это время осиротевшая Майа Мизуки, только что закончившая среднюю школу, уже готова вступить в элитное военизированное Океанское ведомство — часть футуристического мирового правительства. Только лучшие из лучших (как умственно, так и физически) имеют право на поступление туда. Майа намерена стать одной из немногих... Но эта идеальная жизнь очень быстро рушится: к её глубочайшему разочарованию, она терпит крах...

Начало промышленной революции, феодальная Япония в смятении. Правящий сёгун прибегает к жёстким мерам, чтобы внушить страх врагам и показать им, кто главный. Побои, тюремные заключения, изнасилования и даже убийства — его излюбленная тактика. Кто-то должен положить конец этому кровопролитию. Выразителем революционных настроений становятся несколько самураев, которые собрались в группу. Теперь, когда появилось новое оружие и развитые технологии, у них есть не только желание, но и возможность...

Ниси с девяти лет был влюблён в Мён, однако признаться духу не хватило. Случайно встретив девушку в метро, наш герой предлагает проводить её до дома. И по пришествии вляпывается в потрясающую историю, включающую в себя смерти, неадекватных якудза, полную денег и наркоты тачку, огроменного кита и старичка, который в этом ките живёт. Теперь парню, которому не хватило смелости даже на признание, надо найти смелости, чтобы выбраться из этой нереальной передряги самому, да ещё и спасти девушек,...

Нодзому Футами возвращается в город, в котором он жил в детстве, ходит в школу и подрабатывает в местном храме. Его мать умерла, а отец работает за рубежом. Вскоре он оказывается втянутым в местную легенду девочек-близнецов, полюбивших одного человека. И, как выясняется, в этом городе есть ещё много девочек-близнецов......

...

Кото, страстно увлекающаяся косплеем школьница, попадает под ритуал вместе с командой девочек-волшебниц. В результате люди исчезают, в мире появляются черные башни-печати, а Кото становится обладательницей браслета девочки-волшебницы. Появившиеся принцесса Такицу объявляет, что лишь уничтожение появившихся после ритуала башен, охраняемых монстрами, вернет мир и порядок....

На заколдованном острове находится поселение странного народа полудемонов. Но остров был захвачен четырьмя злобными богами, которые раз в 50 лет убивают по одному ребенку-полудемону, чтобы поддержать свою силу. Остров скрыт от внешнего мира, однако, когда происходят эти жертвоприношения, остров появляется во «внешнем мире». Дети не могут сбежать, так как все они отмечены «огненными шрамами», привязывающими детей к этому месту. Лишь одна девушка лишена этих шрамов — ее и посылают во внешний мир...

...

Эта OVA состоит из двух отдельных историй с несколькими общими персонажами. Первая история — «За пределы воспоминаний» — рассказывает о парне Сёго и его девушке Нэо. Однажды они встречают Канату, бывшую подругу Сёго. Эта встреча заставляет Нэо задуматься об их с Сёго отношениях. Вторая история — «Когда сбываются молитвы» — о девушке по имени Инори и её парне Иссю. Они дали обещание каждый год вместе ходить на фестиваль фейерверков и любоваться представлением с площадки, на которой они стали...

Прошло много лет после событий первого фильма. «9-й Отдел» по-прежнему выполняет свою работу. Киборгизированный полицейский Бато с партнером Тогусой после таинственного исчезновения "Майора" Мотоко Кусанаги назначаются расследовать серию убийств, совершенных прототипами гиноидов, самоуничтожающимися после этого. Но перед самоуничтожением один из таких гиноидов попросил Бато о помощи......