Освободившись от своих обязанностей с 501-ым секретным отделом, Мотоко Кусанаги теперь должна выполнять приказы Дайсукэ Арамаки. Кто-то взломал искусственный интеллект Логикомы и Бато начинает собирать команду. Он заручается поддержкой бывшего армейского офицера разведки Исикавы и специалиста по взрывчатке и подрывному делу Бомы. Кусанаги также стремится привлечь к этому расследованию снайпера Сайто и тайного агента Падзу. Девятый отдел разворачивает очередную операцию....

История разворачивается в декабре 2199, когда люди с нетерпением ожидают окончания старого года и начала нового. Во время торжеств начинают распространяться слухи, что Рагна Бладэдж, повстанец SS-класса, за чью голову обещана самая высокая награда, появляется в 13-м иерархическом городе Кагуцути. Очевидной целью Рагны является уничтожение системы управления миром. Но до этого ему предстоит избавиться от охотников за головами, которые отправляются в Кагуцути, соблазнённые обещанной наградой....

Томоко Куроки — популярная старшеклассница, у которой 50 лет опыта свиданий и 100 парней... в игровом мире. В реальном мире она пятнадцатилетняя хикикомори, обладающая всеми качествами «моджо» (мрачная или непопулярная девушка). Однако, когда в школе всё идёт не так, как она ожидала, и она оказывается не так популярна, как думала, Томоко в первый раз за несколько лет смотрит на себя в зеркало и решается на шокирующие изменения......

«Пришло время учиться жить самостоятельно!» — так однажды решил для себя Юго Хачикэн и поступил в академию сельского хозяйства. Он наивно полагал, что любая учёба, с его-то талантами, пойдёт как по маслу. Однако парень, воспитанный в городской среде, не догадывался, что с виду беззаботная жизнь фермера таит в себе множество подводных камней и тяжёлых испытаний. Ходить в грязной, неудобной одежде, работать до потери пульса, пытаться находить общий язык с деревенскими подростками — как тут не...

Клуб современной культуры снова в строю! Состав Гэнсикэна претерпел значительные изменения: ушли основатели кружка, но - свято место пусто не бывает! - на замену им пришли американка Сюзанна, первокурсницы Рика и Мирэй, а также "Mysterious Beauty" по имени Хато-сан. В каком направлении будет развиваться клуб? Какую "изюминку" привнесет новое поколение отаку? На что способны пойти герои во имя дружбы?.....

...

Эпизод-связка, вышедший с ограниченным изданием 6-го тома манги, о времени между вторым и третьим ТВ-сезонами....

Эта история о трёх молодых специалистах — Ютаке Хасэбэ, Люси Ямагами и Сае Миёши, которые недавно устроились на работу в департамент здравоохранения городского муниципалитета. Работа отнюдь не простая и весьма ответственная, поэтому неудивительно, что к нашим героям в качестве наблюдателя приставили более опытного коллегу — Тайши Ичимию. В теории их подготовка должна была пройти без каких-либо проблем, однако недавние студенты явно не желают превращаться в типичный офисный планктон! Их...

Короткая история, которая происходит в лаборатории KDDI R&D, где ученые пытаются создать телефон, который мог бы звонить в будущее, но во время использования изобретения происходит неожиданный инцидент....

История о школьной жизни трёх девушек — Юзуко, Юкари и Юи — в клубе обработки данных. Неординарная дружба этих трёх неунывающих особ создаёт комические ситуации даже в самых простых событиях....