В 1972 году экипаж «Аполлона-17» обнаружил на поверхности Луны так называемые Гиперврата, способные посредством телепортации проложить путь на Марс. В дополнение к Гипервратам, в ходе исследования планеты, землянам также посчастливилось открыть ещё одно наследие древней цивилизации — могучую технологию, позже названную «Альдноа». Сила этой технологии оказалась настолько велика, что первые люди, ступившие на поверхность Марса, едва заполучив её, возомнили себя избранниками богов. Выбрав путь...

Тэцуро Хосино — юный беспризорник, живущий на улице. А всё из-за того, что его мать ради развлечения убил граф Меха. У Тэцуро есть мечта: несмотря ни на что раздобыть себе механическое тело и отомстить за смерть матери. Для этого ему нужно получить дорогостоящий билет на «Галактический экспресс 999» — космический поезд, который отвезёт его на планету, где можно бесплатно получить механическое тело. Во время попытки украсть билет полиция почти ловит мальчика, но его спасает Мэйтел и предлагает...

В далёком будущем люди живут на колонизированных планетах, и каждый аспект их жизни контролируется системой компьютеров. В результате эволюции начали рождаться люди с экстраординарными способностями. Эту новую расу стали называть мью. Ненавидимые и презираемые людьми, мью мечтают о месте, где они смогут жить в мире — о Терре, далёкой мистической планете, с которой давным-давно пришлось улететь человечеству из-за чрезмерно возросшего уровня разрушения и загрязнения окружающей среды. Джоми Маркиз...

В 1889 году мир переживает техническую революцию. Но не всё идёт гладко — зловещий враг, известный как Гаргойл, одержимый идеей восстановления империи Атлантов, начинает приводить в жизнь планы по захвату мира. Надя, молодой изобретатель Жан и капитан Немо, путешествующий на подводной лодке Наутилус, начинают свою борьбу против Гаргойла и его Нео-Атлантиса....