Ангелы продолжают свои непрерывные атаки, а в Nerv появляются два новых пилота: пилот павшего в первом же бою Евангелиона-05 Мари Илластриэс Макинами и пилот Евы-02, а позже Евы-03 Аска Лэнгли Сикинами. В то же время Гэндо Икари и Seele приступают к проекту совершенствования человечества, в котором задействованы Рей с Синдзи и загадочный мальчик Каору Нагиса....

Компиляция серий одноимённого сериала с небольшим добавлением новых сцен. В начале 21 века по официальной версии в Антарктиде падает метеорит. Это приводит к растоплению льдов и затоплению всех прибрежных территорий. Мир на время погружается в хаос, но потом начинает понемногу восстанавливаться. Это событие было названо «Второй удар». Школьника Икари Синдзи вызывает к себе отец, являющийся главой могущественной организации NERV. Под давлением отца и обстоятельств Икари начинает пилотировать...

После Второго удара всё, что остаётся от Японии — это город Токио-3, подвергаемый постоянным атакам гигантских существ, стремящихся уничтожить человечество, называемых Ангелами. Синдзи Икари, до этого не видевшийся с отцом три года, получает от него телефонный звонок с требованием немедленно прибыть в штаб-квартиру Nerv, организации, противостоящей Ангелам. Для борьбы с Ангелами.Nerv используют гигантских роботов, называемых Евангелионами. Задачей Синдзи становится пилотирование Евы-01 и работа...

После событий второго фильма Синдзи Икари пробуждается спустя 14 лет. Он не понимает, что происходит, но постепенно ему открывается пугающая истина. В результате Синдзи придётся снова сражаться с Ангелами вместе с неожиданными союзниками, преодолевая сопротивление бывших друзей. И снова судьба бросит его на передовую войны и заставит принимать решение за всё человечество. Что же он выберет в этот раз?...

Абсолютное многоцелевое гуманоидное оружие человечества и искусственный человек Евангелион стояли на страже государственной безопасности. Начинается подготовка к операции, в рамках которой происходит проверка координат судна. На борту стояла девушка, мечтавшая увидеть Город Цветов. А другие члены экипажа старательно трудились над вводимыми кодами в компьютеры, чтобы активировать «Систему Анти-Эл». Один из членов считал, что повторение с 4-го этапа точно сработает и все это благодаря стараний...