В разгаре войны между натуралами (OMNI) и координаторами (ZAFT) некий боец-координатор отправлен раздобыть недавно произведённый Земным альянсом в колонии натуралов Гелиополисе мобильный доспех. Координатор гражданской сферы Кира Ямато посещает технический колледж Гелиополиса. Как только «ZAFT» силой забирает четыре из пяти мобильных доспехов, Кира натыкается на оставшийся — «Страйк» (Strike), после чего он вынужден пилотировать его, чтобы спасти свою жизнь и жизни друзей. Во время случившегося...

Прошло два года с окончания войны между EAF и Координаторами. В мире установились шаткие покой и равновесие, которые, впрочем, не устраивают ни тех, ни других. Чтобы возобновить конфликт, группа координаторов направляет колонию Юниус 7 на Землю, рассчитывая на то, что её падение уничтожит практически всё население Земли. Силами ZAFT колония взорвана, но её осколки наносят поверхности планеты огромный урон, и война разгорается с новой силой. Главные герои вынуждены вновь взяться за оружие, чтобы...

...

Силы Зла реализуют новый план, который на этот раз позволит одолеть Спасителя. Ночью, в дом Ватару, был отправлен Хранитель Ада. Дух Дракона украл воспоминания мальчика, а доброе и смелое сердце заменил злым. С этого момента поведение и личность подростка изменились. Справедливый герой превратился в отъявленного злодея, желающего контролировать всех хулиганов города. Чтобы достичь поставленной цели, осталось одолеть двух последних противников, которые наотрез отказывались ему подчиниться и...

Спокойные деньки продлились совсем недолго. На небосводе звёзды изменили своё положение, а над горой Соукай исчезла радуга. Известно, что источник энергии, питающий радугу, расположен на Звёздной горе Шинкай в далёком космосе. Поэтому, чтобы миром навсегда не завладела темнота, необходимо отправиться на спасение Звёздной горы. На этот раз маленьким спасателям необходимо будет победить Доакадара - брата демона тёмных сил Доакудара. Друзья юного Ватару уже в пути, они не дождались мальчика....

Ватару всего девять и он ходит в школу. Парень старался вести себя, как и все его сверстники, но он и представить не мог, что вся его жизнь изменится до неузнаваемости. Все началось в тот момент, когда он возвращался домой вместе с роботом, которого он вылепил накануне в школе. Парня уносит в свой мир дракон, где уже давно бытует легенда о том, что появится спаситель по имени Ватару и сможет вернуть радуге все цвета. Тогда мир будет спасён, и его жители смогут зажить тихой и спокойной жизнью....