Эта история происходит в 21-м веке в Японии – только это совсем не та Япония, которую знаем мы. Представьте себе, что Токугавский сёгунат не пал в 1868 году, страна всё ещё изолирована от внешнего мира, а институт самураев процветает. Вот такая она, альтернативная Япония… У подножья священной горы Фудзи расположилась академия Буо, где надежда и цвет японской нации встаёт на нелёгкий путь самурая. В академии в относительной гармонии находятся классические японские боевые искусства и современные...

Человечество снова понесло потери. Харуо сомневается в следующем шаге. Маина и Миана выражают предостережение в отношении Метфиса, который, будучи поражённым чудесным выживанием Харуо, начинает привлекать последователей, проповедуя им о «конечной цели» происходящего. У человечества не осталось средств для победы над Годзиллой, а тем, кому удалось выжить, выпала судьба наблюдать, как на планету спускается крылатое существо, испускающее золотой свет, Король Гидора. Война переходит на новый...

Прибыв на Землю спустя 20 000 лет, Харуо вместе с остатками человечества обнаруживают, что планета стала совершенно другой. Флора и фауна здесь олицетворяют Годзиллу, а сама Земля спустя тысячелетия превратилась в планету-монстра, управляемую гигантской Годзиллой высотой 300 метров. Человечество оказывается на грани исчезновения и вынуждено бороться за своё выживание. Жаждущий победить Годзиллу и вернуть планету человечеству, Харуо встречает на Земле потомков коренных народов, племя Хутуа....

Аниме расскажет о Шин Соне, обычном молодом человеке, живущем в наше время. Однажды во сне он ломает печать и тем самым стирает прошлое о периоде Троецарствия. По неизвестным ему причинам он начинает путешествие назад во времени и оказывается втянут во временную линию Троецарствия....

В последний год 20-го столетия люди неожиданно узнали, что являются не единственными жителями планеты. Неожиданная встреча людей с двумя ужасными существами кайджу и годзиллой приводит к ожесточённой битве, которая продлилась более 500 лет. Из-за постоянных поражений люди решают покинуть Землю и переселиться на другую планету, схожую с Землёй. После многочисленных поисков подходящей планеты, учёные выяснили, что планета Тау, находящаяся на расстоянии 11.9 световых лет от Земли, больше всего...