История начинается с того, как мальчик по имени Такуя получает на свой телефон загадочное сообщение. Прочитав его, паренёк отправляется на станцию, указанную в тексте. Прибыв на место, Такуя попадает в очень странное место, где полным-полно детей и поездов. Сев на один из них, мальчик, вместе с ещё четырьмя людьми, отправляется в Цифровой мир, который им предстоит спасти. По пути они должны будут найти духов, при помощи которых друзья смогут превращаться в легендарных дигимонов. Однако враги...

В мире наступил покой. Прошло немало времени с тех пор, как «Единые сердцем» победили Багурамона. Однако всё так просто не заканчивается... Тагиру, одноклассник Ю, так же, как и он, играет в баскетбол. Тагиру пытается всячески походить на Тайки и думает только лишь о том, как бы его превзойти — он же с ним в одной команде. После очередного матча Тагиру отправляется на прогулку, во время которой замечает следящую за ним тень. Побежав за ней, он попадает в иной мир. Как оказалось, тот, за кем он...

...

Прошло три года с тех пор, как «избранные» спасли цифровой мир от зла. Дети повзрослели, а то, что когда-то происходило, забылось. Теперь новому поколению «избранных» предстоит снова стать героями, ведь в мире дигимонов объявился новый враг — Император Дигимонов, который не только унижает дигимонов, но и использует их в своих тёмных умыслах. Для выполнения этой цели были выбраны три новых ребёнка — Дайсукэ Мотомия, Иори Хида и Мияко Иноуэ. Получив свои дигивайсы и собственных дигимонов, ребята...

...

...

Нубэ — неуклюжий спокойный и очень добрый учитель. Однако, как водится, у него есть секрет: в его левую руку был помещён демон, и поэтому он прячет её под перчаткой. Ещё Нубэ может чувствовать присутствие призраков и злых духов. Используя силу своей проклятой руки, он защищает своих учеников от злых духов....

В класс адского учителя Нубэ переводится новый ученик по имени Дзюн. Он скромный мальчик, у которого, к сожалению, нет друзей. Единственный его друг Пьер — демон-клоун из зеркала. И вот однажды Пьер дарит Дзюну маску с удивительными способностями: надев её, Дзюн начинает вести себя очень странно....