Действие фильма происходит на современном корабле военно-морских сил обороны Японии “Эгида”. На борту судна было найдено тело военнослужащего без левой руки. Поступила информация о том, что опасный шпион “X” проник на корабль, тем самым угрожая безопасности всей страны. Но диверсант еще не догадывается, что вероятность успеха его операции крайне мала, ведь за дело берется прославленный детектив Конан. Юный сыщик в силах распутать самый сложный заговор, спасти жизни дорогих ему людей и поймать...

...

...

В результате сотрудничества с J-лигой профессиональных игроков Японии по футболу, Конан и его команда оказываются на огромном стадионе, где проходит матч между командами Токио и Осаки. Задача детективов - узнать, кто заложил бомбу замедленного действия на стадионе и предотвратить взрыв. И всё это нужно сделать до окончания матча!...

...

Хэйджи и «детективная компания» приехали навестить Конана в Токио. Вернувшись из недавней поездки, друзья привезли с собой сувениры, но из-за большой схожести они оказались перепутаны. Великий детектив решает разгадать эту загадку и расспрашивает о том, что происходило по дороге в Токио....

История начинается с угроз против губернатора Токио. Вскоре, лишь с помощью умения Конана быстро мыслить и предсказывать любые смертельные исходы, удаётся предотвратить взрыв в туннеле метро. Конан получает информацию, что возможна связь преступника с деревней, которая была перенесена из-за строительства дамбы. И великому детективу приходится мчаться со всех ног, чтобы остановить преступника перед тем, как он осуществит следующую атаку....

Легендарный вор Кайто Кид снова в деле! «Украден бриллиант стоимостью 300 миллионов иен!» — пестрят первые полосы всех газет и доносится из каждого динамика в городе. Эта новость не обошла стороной и нашего главного героя. Знакомьтесь, Кайто Куроба, ученик старшей школы. Сын великого иллюзиониста Тоичи Куробы, погибшего при загадочных обстоятельствах восемь лет назад. Имея незаурядный талант фокусника, а также помня уроки магии, полученные в детстве от отца, Кайто постоянно докучает всем...

...

В этой совершенно новой истории, выпущенной только на DVD, Эдогава Конан вместе с молодыми детективами выходят против призрачного вора Каито Кида, который нацелился на драгоценный камень, выставляемый в отеле на острове, куда приехали отдохнуть наши герои...