В разгаре войны между натуралами (OMNI) и координаторами (ZAFT) некий боец-координатор отправлен раздобыть недавно произведённый Земным альянсом в колонии натуралов Гелиополисе мобильный доспех. Координатор гражданской сферы Кира Ямато посещает технический колледж Гелиополиса. Как только «ZAFT» силой забирает четыре из пяти мобильных доспехов, Кира натыкается на оставшийся — «Страйк» (Strike), после чего он вынужден пилотировать его, чтобы спасти свою жизнь и жизни друзей. Во время случившегося...