2977 год. Человечество перестало развиваться. Все работы выполняются машинами, в то время как люди тратят всё своё время на развлечения. Когда таинственная инопланетная раса мазонов начинает вторжение, земное правительство не принимает попыток борьбы за независимость, и только легендарный космический пират капитан Харлок, вместе со своим экипажем и звездолётом «Аркадия», решает в одиночку вести борьбу против инопланетных агрессоров....

Хадзимэ Амамори — обычный молодой паренёк, который каждый день ходит в школу, старается хорошо учиться и весело проводит время с друзьями. Но однажды пришёл конец его нормальной жизни. В ходе неудачного эксперимента родители Амамори погибают. Оставшись сиротой, Хадзимэ вынужден переехать к своему дяде, профессору обсерватории, от которого он узнаёт, что в 1999 году 9 сентября в 9 часов 9 минут и 9 секунд Земля столкнётся с огромной планетой, называемой Ла-Метал, что вызовет настоящий конец...

...

...

...

...

...

...

В 2199 году инопланетная раса из Империи Гамилус во главе с Лордом Деслером нападает на Землю, чтобы завоевать её. Поскольку их родной атмосферой является радиация, то они обстреливают радиоактивными астероидами поверхность планеты, делая в итоге жизнь на её поверхности непригодной для людей, из-за чего человечество вынуждено уйти под землю. Однако радиация оказывает своё разрушительное влияние даже на подземные города. Тем временем на Марсе терпит крушение космический корабль другой...

CGI ремейк оригинального сериала о капитане Харлоке. В далеком будущем человечество расселилось по всей галактике, однако вскоре оказалось на грани вымирания и попыталось вернуться на Землю. Дабы сохранить колыбель человечества, Земля была объявлена неприкосновенной территорией. Однако у людей не было иного пути спасения, кроме как возвращение на родину... В решающий момент появляется Он - космический пират Харлок, капитан призрачного корабля Аркадия. Беглец, готовый сражаться за Землю. Кто же...