За несколько столетий человечество пришло в упадок. Из-за снижения рождаемости огромные территории освободились от людей, и на них пришли феи — существа с высоким уровнем интеллекта, но всего десяти сантиметров в высоту. «Я — представитель ООН по контактам с феями. Я думала, что моя работа не будет тяжёлой и посетила одно из мест обитания фей, чтобы поприветствовать их, но...»...

Котаро Тэннодзи — ученик обычной старшей школы, которая расположена в живописном японском городе Кадзамацури. Он весело проводит время, общаясь со своей единственной подругой детства Котори и подшучивая над горделивым главным хулиганом школы Харухико. Недовольный малым количеством друзей, Котаро решает вступить в клуб оккультизма, президентом которого является старшеклассница Аканэ, известная как «Ведьма». Со временем в клуб вступают Котори, переведённая ученица Тихая, а также две подруги:...

Прожив один из «вариантов» своей жизни, Котаро появился в другом мире. Этот мир очень похож на прежний, однако в нём, кроме одного Котаро, никого нет. С мыслями о том, почему всё так произошло, Котаро бродил по городу, пока не забрёл на холм. Там он обнаружил Кагари, сидящую под деревом и проводящую свои исследования. С помощью них она искала один из «вариантов жизни» Земли, в котором человечество не погибнет и продолжит развиваться дальше. Котаро, так и не поняв всей сути, решает помочь...

Сюжет закручивается вокруг старшеклассника Итиро Сато. Обычный парень в обычной школе с парой обычных друзей, которые мечтают «тусоваться» с самыми популярными учениками школы. Однажды, забыв в парте учебник, Итиро пробирается в школу и встречает там странную девушку, одетую в синюю робу, с посохом в руках. Она представляется ему «Искательницей» и заявляет, что она — ведьма из параллельного мира, пришедшая в мир людей с целью найти «Терминал Дракона». Итиро вызывается помочь ей с поисками, но...